1回戦
8月19日(水)
アルテリーヴォ和歌山 0-6 沼津 [紀三井寺]
ラインメール青森 15-0 秋田大 [カクスタ]
ベルガロッソいわみ 2-0 [みよし陸]
岩手 1-0 札幌大 [いわスタ]
岐阜 3-1 富山新庄クラブ [ヒマスタ]
アトレチコ鈴鹿 1-1 (PK3-1) FC BASARA HYOGO [三交鈴鹿]
SRC広島 1-6 マルヤス岡崎 [Eピース]
FC徳島 1-0 川副クラブ [鳴門大塚]
ヴェロスクロノス都農 3-1 (延長) 讃岐 [いちご]
鹿児島 2-1 山口 [白波スタ]
ヴェルスパ大分 3-0 高知 [クラド]
北九州 1-2 (延長) 沖縄SV [ミクスタ]
愛媛 2-1 IPU・環太平洋大 [ニンスタ]
鳥取 2-2 (PK6-5) 熊本 [Axis]
奈良 1-4 FC大阪 [ロートF]
滋賀 2-1 JAPANサッカーカレッジ [HATOスタ]
長野 2-1 福井ユナイテッド [サンアル]
山梨学院大 1-0 東京国際大FC [JITス]
専修大 2-1 筑波大 [レモンS]
栃木SC 2-0 浦安市川 [カンセキ]
流通経済大 1-2 (延長) クリアソン新宿 [Ksスタ]
東北学院大 1-3 群馬 [ユアスタ]
福島 7-0 大山サッカークラブ [とうスタ]
金沢星稜大 1-4 京都産業大 [石川西部]

2回戦
8月26日(水)
徳島 3-0 FC徳島 [鳴門大塚]
広島 4-1 沖縄SV [福山]
C大阪 3-1 岐阜 [ハナサカ]
横浜FC 3-1 クリアソン新宿 [ニッパツ]
町田 3-0 岩手 [Gスタ]
東京V 4-1 群馬 [味フィ西]
名古屋 1-3 鳥取 [豊田ス]
湘南 1-0 ラインメール青森 [レモンS]
新潟 0-4 鹿児島 [デンカS]
清水 2-1 (延長) FC大阪 [アイスタ]
柏 2-1 専修大 [三協F柏]
磐田 0-1 (延長) 宮崎 [ヤマハ]
京都 1-0 マルヤス岡崎 [たけびし]
G大阪 2-0 滋賀 [パナスタ]
神戸 2-1 ヴェロスクロノス都農 [ノエスタ]
岡山 3-0 ベルガロッソいわみ [JFEス]
今治 4-1 秋田 [アシさと]
福岡 0-0 (PK5-4) ヴェルスパ大分 [ベススタ]
鳥栖 4-0 富山 [駅スタ]
長崎 3-2 愛媛 [ピースタ]
山形 3-5 (延長) 藤枝 [NDスタ]
横浜FM 1-0 福島 [日産ス]
札幌 1-3 甲府 [プレド]
仙台 1-2 栃木C [ユアスタ]
いわき 2-0 (延長) 大分 [ハワスタ]
鹿島 3-0 アトレチコ鈴鹿 [メルスタ]
水戸 0-2 京都産業大 [Ksスタ]
浦和 3-0 山梨学院大 [浦和駒場]
大宮 2-0 八戸 [NACK]
千葉 1-1 (PK8-7) 沼津 [フクアリ]
FC東京 6-0 長野 [味スタ]
川崎F 3-1 栃木SC [U等々力]

3回戦
9月23日(水)
鹿島 3-1 甲府 [メルスタ]
柏 4-0 今治 [三協F柏]
町田 2-1 栃木C [Gスタ]
京都 1-0 藤枝 [サンガS]
G大阪 5-0 徳島 [パナスタ]
神戸 1-0 鳥栖 [ノエスタ]
10月7日(水)
浦和 3-2 大宮 [NACK]
福岡 0-1 横浜FC [ニッパツ]
C大阪 2-0 鹿児島 [ハナサカ]
広島 4-0 いわき [ハワスタ]
川崎F 2-0 宮崎 [いちご]
清水 2-1 (延長) 長崎 [アイスタ]
FC東京 4-0 湘南 [レモンS]
横浜FM 2-1 京都産業大 [日産ス]
鳥取 0-0 (PK3-4) 東京V [味スタ]
岡山 1-0 千葉 [フクアリ]

4回戦
12月9日(水)
G大阪 18:00 浦和 [パナスタ]
町田 18:30 東京V [Gスタ]
神戸 19:00 清水 [ノエスタ]
鹿島 19:00 C大阪 [メルスタ]
横浜FC 19:00 FC東京 [ニッパツ]
川崎F 19:00 横浜FM [U等々力]
柏 19:00 岡山 [三協F柏]
京都 19:00 広島 [サンガS]