プレーオフラウンド(1-4位決定戦)第1戦
5月30日(土)
仙台 1-0 甲府 [ユアスタ]
富山 1-0 宮崎 [長野U]

プレーオフラウンド(5-8位決定戦)第1戦
5月30日(土)
新潟 0-1 鹿児島 [デンカS]
5月31日(日)
秋田 1-1(PK5-4)札幌 [ソユスタ]

プレーオフラウンド(9-12位決定戦)第1戦
5月30日(土)
湘南 1-2 いわき [レモンS]
徳島 3-1 鳥栖 [鳴門大塚]

プレーオフラウンド(13-16位決定戦)第1戦
5月30日(土)
横浜FC 2-1 大宮 [ニッパツ]
高知 2-3 山口 [ギケンス]

プレーオフラウンド(17-20位決定戦)第1戦
5月30日(土)
相模原 4-3 藤枝 [ギオンス]
愛媛 0-1 熊本 [ニンスタ]

プレーオフラウンド(21-24位決定戦)第1戦
5月31日(日)
群馬 0-1 岐阜 [正田スタ]
金沢 1-3 鳥取 [ゴースタ]

プレーオフラウンド(25-28位決定戦)第1戦
5月30日(土)
奈良 4-3 大分 [ロートF]
5月31日(日)
山形 1-2 松本 [NDスタ]

プレーオフラウンド(29-32位決定戦)第1戦
5月30日(土)
栃木C 3-3(PK3-1)磐田 [CFS]
FC大阪 0-1 滋賀 [花園]

プレーオフラウンド(33-36位決定戦)第1戦
5月31日(日)
今治 1-2 琉球 [アシさと]
6月1日(月)
八戸 0-1 福島 [プラスタ]

プレーオフラウンド(37-40位決定戦)第1戦
5月31日(日)
栃木SC 0-0(PK3-5)長野 [カンセキ]
讃岐 3-1 北九州 [メグスタ]

プレーオフラウンド(1-2位決定戦)第2戦
6月6日(土)
仙台 1-1(PK4-2)富山 [ユアスタ]

プレーオフラウンド(3-4位決定戦)第2戦
6月6日(土)
宮崎 2-1 甲府 [いちご]

プレーオフラウンド(5-6位決定戦)第2戦
6月7日(日)
秋田 0-2 鹿児島 [ソユスタ]

プレーオフラウンド(7-8位決定戦)第2戦
6月6日(土)
新潟 0-0(PK5-4)札幌 [デンカS]

プレーオフラウンド(9-10位決定戦)第2戦
6月7日(日)
徳島 2-0 いわき [鳴門大塚]

プレーオフラウンド(11-12位決定戦)第2戦
6月6日(土)
鳥栖 1-0 湘南 [駅スタ]

プレーオフラウンド(13-14位決定戦)第2戦
6月6日(土)
横浜FC 2-1 山口 [ニッパツ]

プレーオフラウンド(15-16位決定戦)第2戦
6月6日(土)
大宮 2-1 高知 [NACK]

プレーオフラウンド(17-18位決定戦)第2戦
6月6日(土)
相模原 3-0 熊本 [ギオンス]

プレーオフラウンド(19-20位決定戦)第2戦
6月6日(土)
藤枝 1-0 愛媛 [藤枝サ]

プレーオフラウンド(21-22位決定戦)第2戦
6月6日(土)
岐阜 1-1(PK2-4)鳥取 [アイスタ]

プレーオフラウンド(23-24位決定戦)第2戦
6月7日(日)
金沢 4-1 群馬 [ゴースタ]

プレーオフラウンド(25-26位決定戦)第2戦
6月6日(土)
松本 0-2 奈良 [サンアル]

プレーオフラウンド(27-28位決定戦)第2戦
6月7日(日)
大分 1-0 山形 [クラド]

プレーオフラウンド(29-30位決定戦)第2戦
6月6日(土)
栃木C 3-1 滋賀 [CFS]

プレーオフラウンド(31-32位決定戦)第2戦
6月6日(土)
磐田 2-2(PK4-5)FC大阪 [ヤマハ]

プレーオフラウンド(33-34位決定戦)第2戦
6月7日(日)
福島 1-1(PK5-4)琉球 [とうスタ]

プレーオフラウンド(35-36位決定戦)第2戦
6月7日(日)
八戸 1-1(PK3-5)今治 [プラスタ]

プレーオフラウンド(37-38位決定戦)第2戦
6月5日(金)
讃岐 0-0(PK3-5)長野 [メグスタ]

プレーオフラウンド(39-40位決定戦)第2戦
6月7日(日)
栃木SC 2-1 北九州 [カンセキ]